出库处理的主要作用就是根据与客户达成的协议向客户提供协议规定的物品。出库处理包含下列功能：订单接收、开票、收款。以上列出的功能已经在ERP中得以实现，实际上并不包含在WMS管理中，但当仓储作业人员接收到订单后，将会触发下列作业：拣货、装运、物流信息跟踪、运达信息确认、库存信息更改。而以上这些作业在ERP系统中并不存在，但却存在于WMS系统之中。
生产订单拣货作业主要是根据生产计划所生成的供应订单进行拣货作业，并将所需物品配送至生产线上的作业过程。实际上，在生产订单作业处理中，订单信息来源于生产计划以及当前的原材料库存。由于生产订单所决定的拣货可能会超出仓储作业能力，同样，仓储拣货作业如果独立产生也会因为生产时序的限制而受到执行限制，从而造成人力、物力资源的浪费。因此，对于生产订单的拣货作业，首先必须从ERP系统的物料需求出发，考虑生产节奏以及当前仓储作业节奏设定，再通过仓储管理系统生成捡货计划。因此生产订单捡货计划功能必须通过和ERP系统生产计划功能的联动才能实现最佳作业效果。
另外，在客户订单拣货方面也有着不同的需求。客户订单的拣货作业与生产订单不同，其主要作业内容是根据客户订单需求，组织已经生产完成的物品(产成品)，并根据需要组装成客户所需要的产品，并最终将产品送到客户手中。一般情况下，这种拣货处理对仓库来说是经常发生的。随着客户对产品的个性化要求日益增高，仓储拣货作业也逐渐从量拣趋向批拣甚至单拣的作业方式。为了适应这种作业需求，就需要有一套完整的仓储作业管理系统对其进行支持，告诉仓储管理人员应该在什么地方、什么时候去拣什么货，拣多少，并告诉仓储作业人员如何将拣出的货物组装和装运到客户所在地。
收入处理及仓储作业中的收货管理
收入处理主要包括采购订单接收以及根据采购订单进行原材料收货和存储管理，收货处理相对与前述的发出处理，没有多重作业方向的选择，而是特定作业，这些作业主要包括下列作业功能：采购订单生成、采购订单接收、供应商发票处理、付款处理、以及应付账款处理。
根据上述作业特性，采购作业所产生的管理作业最终将全部体现在仓储管理作业之中，即使某些企业没有采用ERP系统，其原材料收入和存储信息仍然需要仓储管理部门实时地掌握和提供给管理部门。因此，对于收入作业最好采用WMS系统进行。
仓储管理系统在接收采购订单以后，将通过下列功能实现仓储作业管理和控制：采购订单审核、收货处理、验货、条码和标签处理、选位、上架。通过上述处理，可以将已经收到的物品存放在更加容易访问和拣取的地方，同时采用ES/1的选位和上架规则可以更加有效地利用有限的存储空间，缩短作业动线，提高作业速度。条码与标签系统是WMS系统中特有的实时控制系统，利用该功能可以提高仓储信息的准确率和信息的实时对质。使仓储实物信息和WMS系统内的信息保持实时同步。在和ERP系统的信息整合方面，主要是通过WMS系统实时更新ERP系统的存货信息，使ERP系统的实际存货信息与WMS系统内的实物库存信息保持同步。
