报关单修改和撤销分两种情形，一种是进出口货物收发货人或者其代理人申请修改或者撤销进出口货物报关单，另一种情形是根据海关要求对进出口货物报关单进行修改或者撤销。2、适用范围本流程所称报关单修改和撤销，既包括进出口货物收发货人或者其代理人申请修改或者撤销进出口货物报关单，也包括根据海关要求对进出口货物报关单进行修改或者撤销。本流程同时适用于进出境备案清单的修改、撤销。3、适用限定海关已经决定布控、查验的以及涉案的进出口货物的报关单在办结前不得修改或者撤销。4.报关单修改和撤销的管理各直属海关负责本关区进出口货物报关单修改和撤销的管理工作。经授权的隶属海关和办事处可以办理进出口货物报关单的修改和撤销。
二、报关单修改和撤销流程(进出口货物收发货人或者其代理人申请修改和撤销的情形)1、提出申请的理由如下正当理由的，进出口货物收发货人或者其代理人可以向原接受申报的海关申请修改或者撤销进出口货物报关单：
(一)由于报关人员操作或者书写失误造成所申报的报关单内容有误，并且未发现有走私违规或者其他违法嫌疑的;
(二)出口货物放行后，由于装运、配载等原因造成原申报货物部分或者全部退关、变更运输工具的;
(三)进出口货物在装载、运输、存储过程中因溢短装、不可抗力的灭失、短损等原因造成原申报数据与实际货物不符的;
(四)根据贸易惯例先行采用暂时价格成交、实际结算时按商检品质认定或者国际市场实际价格付款方式需要修改申报内容的;
(五)由于计算机、网络系统等方面的原因导致电子数据申报错误的;
(六)其他特殊情况经海关核准同意的。2、提出修改和撤销申请
进口货物放行后或者出口货物办结海关手续后，进出口货物收发货人或者其代理人提出修改和撤销申请的，相应提交下列有关单证：(一)《进出口货物报关单修改/撤销申请表》;(二)可以证明进出口实际情况的合同、发票、装箱单等相关单证;(三)外汇管理、国税、检验检疫、银行等有关部门出具的单证;(四)应税货物的海关专用缴款书、用于办理收付汇和出口退税的进出口货物报关单证明联等海关出具的相关单证。3、申请需经海关审查并作出决定的情形申请修改或者撤销进出口货物报关单并且同时具有下列情形的，海关按规定程序办理审批：
(一)进口货物放行后或者出口货物办结海关手续后提出申请的;
(二)申请修改或者撤销的内容涉及进出口货物报关单的商品编号、商品名称及规格型号、币制、单价、总价、原产国(地区)、最终目的国(地区)、贸易方式(监管方式)、成交方式之一的。4、不需审查、海关直接决定是否予以修改或者撤销之情形申请修改或者撤销进出口货物报关单不属于应审查范围的，由海关直接决定是否予以修改或者撤销，并且在《进出口货物报关单修改/撤销申请表》上予以批注。
予以修改或者撤销的，海关应当及时完成相关操作;不予修改或者撤销的，应当及时通知进出口货物收发货人或者其代理人，并且说明理由。
5、海关审查、作出决定海关对于需经审查的修改或者撤销进出口货物报关单申请，应当根据情形分别作出处理：(一)申请材料齐全的，由海关向进出口货物收发货人或者其代理人制发《进出口货物报关单修改/撤销申请受理决定书》。能够当场作出审查决定的，制发准予或者不予修改、撤销的决定书，不再制发《进出口货物报关单修改/撤销申请受理决定书》;(二)申请材料存在错误可以当场更正的，应当允许进出口货物收发货人或者其代理人当场更正;
(三)申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当告知进出口货物收发货人或者其代理人需要补正的全部内容，并向进出口货物收发货人或者其代理人制发《进出口货物报关单修改/撤销申请告知书》;(四)申请人不属于有关进出口货物的收发货人或者其代理人的，由海关向申请人制发《进出口货物报关单修改/撤销申请不予受理决定书》。经审查决定予以修改或者撤销的，应当向进出口货物收发货人或者其代理人制发《准予修改/撤销进出口货物报关单决定书》，并完成相关操作。经审查决定不予修改或者撤销的，应当向进出口货物收发货人或者其代理人制发《不予修改/撤销进出口货物报关单决定书》6.海关审批时限海关决定受理进出口货物报关单的修改或者撤销申请的，应当及时对申请材料进行审查。除可以当场决定的外，海关应当自受理进出口货物报关单修改或者撤销申请之日起20日内作出决定并完成相关操作，特殊情况下，海关审查时限可以延长10日。7.许可证件补办因修改或者撤销进出口货物报关单导致需要变更、补办进出口许可证件的，进出口货物收发货人或者其代理人应当向海关提交相应的进出口许可证件。
三、报关单修改和撤销流程(海关发现进出口货物报关单需要进行修改或者撤销的情形)1、海关提出修改或者撤销并发出通知海关发现进出口货物报关单需要进行修改或者撤销，但进出口货物收发货人或者其代理人未提出申请的，海关应当通知进出口货物的收发货人或者其代理人。2、进出口货物收发货人或者其代理人填写确认书进出口货物收发货人或者其代理人应当填写《进出口货物报关单修改/撤销确认书》，对进出口货物报关单修改或者撤销的内容进行确认，确认后海关完成对进出口货物报关单的修改或者撤销。3、许可证件补办因修改或者撤销进出口货物报关单导致需要变更、补办进出口许可证件的，进出口货物收发货人或者其代理人应当向海关提交相应的进出口许可证件。
三、法律政策依据中华人民共和国海关法海关总署令2005年第143号 中华人民共和国海关进出口货物报关单修改和撤销管理办法。
