（一） 出境货物检验类：8种
格式1-1 "检验证书"：适用于出境货物（含食品）的品质、规格、数重、包装等检验项目。
格式1-2-1 "生丝品级及公量证书"：适用于证明生丝的品质及公量。
格式1-2-2 "捻线丝品级及公量证书"：适用于证明捻线丝的品质及公量。
格式1-2-3 "绢丝品质证书"：适用于证明绢丝的品质。
格式1-2-4 "双宫丝品级及公量证书"：适用于双宫丝的品质及公量。
格式1-2-5 "初级加工丝品质及重量证书"：适用于证明初级加工丝的品质及重量。
格式1-2-6 "柞蚕丝品级及公量证书"：适用于证明柞蚕丝的品级及公量。
格式1-4 "啤酒花证书"：适用于输往欧盟的啤酒花。（注：此证书只有部分局可以签发）
（二） 出境货物卫生类：2种
格式2-1 "卫生证书"：适用于经检验符合卫生要求的出境食品以及其他需要实施卫生检验的货物。
格式 2-2 "健康证书"：适用于食品以及用于食品加工的化工产品、纺织品、轻工产品等与人、畜健康有关的出境货物。
（三） 出境兽医类：5种
格式 3-1 "兽医（卫生）证书"：适用于符合输往国家或地区与中国有检疫规定、双边检疫协定以及贸易合同要求的出境动物产品。
格式 3-2-1 "兽医卫生证书"：适用于输往俄罗斯的牛肉。
格式 3-2-2 "兽医卫生证书"：适用于输往俄罗斯的猪肉。
格式 3-2-3 "兽医卫生证书"：适用于输往俄罗斯的动物性原料等。包括皮革、角蹄类、肠衣、毛皮和羔羊皮、羊毛、鬃、马尾、鸡鸭鹅及其他禽类的羽毛和羽绒。
格式 3-2-4 "兽医卫生证书"：适用于输往俄罗斯的禽肉等。
（四） 出境动物检疫类：1种
格式 4-1 "动物卫生证书"：适用于：
（1）符合输入国家或者地区与中国有检疫规定、双边检疫协定以及贸易合同要求的出境动物；
（2）出境旅客携带的符合检疫要求的伴侣动物；
（3）符合检疫要求的港澳动物。
（五） 植物检疫类：2种
格式 5-1 "植物检疫证书"：适用于符合输入国家或地区以及贸易合同签订的建议要求的出境植物、植物产品以及其他检疫物（指植物性包装铺垫材料、植物性废弃物等）。
格式 5-2 "植物转口检疫证书"：适用于从输出方运往中国并经中国转口到第三方（包括到港、澳、台等地区）的符合相关建议要求的植物、植物产品以及其他检疫物。
（六） 运输工具检疫类：6种
格式 6-1 "船舶入境卫生检疫证"：适用于入境卫生检疫时没有染疫的或不需要实施卫生处理的国际航行船舶。
格式 6-2 "船舶入境检疫证"：适用于入境卫生检疫时，需实施某种卫生处理或离开本港后应继续接受某种卫生处理的国际航行船舶。
格式 6-3 "交通工具卫生证书"：适用于申请电讯卫生检疫的交通工具，包括船舶、飞机、火车等。
格式 6-4 "交通工具出境卫生检疫证书"：适用于出境交通运输工具的卫生检疫。
格式 6-5 "除鼠证书/免予除鼠证书"：除鼠证书用于船舶实施鼠患检查后，发现鼠患并进行除鼠的情况；免予除鼠证书用于船舶实施鼠患检查后，未发现鼠患亦未采取任何除鼠措施的情况。
格式 6-6 "运输工具检疫证书"：适用于（1）经动植物检疫合格的出入境交通运输工具；（2）经卫生检疫的入境运输工具，如飞机、火车等。（注：入境国际航行船舶卫生检疫用格式6-1或6-2）。
（七） 检疫处理类：2种
格式 7-1 "熏蒸/消毒证书"：适用于经检疫处理的出入境动植物及其产品、包装材料、废旧物品、邮寄物、装载容器（包括集装箱）及其他需检疫处理的物品等。
格式 7-2 "运输工具检疫处理证书"：适用于对出入境交通运输工具熏蒸、消毒、除虫（含灭蚊），包括对交通运输工具员工及旅客用食品、饮用水以及运输工具的压舱水、垃圾、污水等项目实施检疫处理。
（八） 国际旅行健康类：2种
格式 8-1 "国际旅行健康检查证明书"：适用于出入境人员的健康检查证明。
格式 8-2 "国际预防接种证书"：适用于对国际旅行人员的预防接种。
（九） 入境货物检验检疫类：5种
格式 9-1 "检验证书"：适用于（1）经检验不符合要求的货物；（2）报检人要求或交接、结汇、结算需要的情况。
格式 9-2 "卫生证书"：适用于（1）经卫生检验合格的入境食品、食品添加剂；（2）卫生检验不合格的入境食品、食品添加剂。
格式 9-3 "兽医卫生证书"：适用于经检疫不符合我国建议要求的入境动物产品。
格式 9-4 "动物检疫证书"：适用于经检疫不符合我国检疫要求的入境动物。
格式 9-5 "植物检疫证书"：适用于经检疫不符合我国检疫要求的人竟职务、植物产品、植物性包装铺垫材料、植物性废弃物、土壤、毒种、菌种、生物材料等。
（十） 空白证书类：3种
格式 e-1 "空白证书"：适用于规定格式以外的品质检验、鉴定等证书。如品质证书、重/数量证书、外商投资财产价值鉴定证书、冷藏车检验证书、输美陶瓷证书、恶喹酸证书等。
格式 e-2 "空白证书"：适用于规定格式以外的涉及卫生检疫、食品卫生检验、动植物检疫等证书。如卫生证、健康证、兽医证、农残证书、奶槽车检验证书、冷藏车检验证书等。
格式 e-3 "空白证书"：适用于需要正反面打印的证书。如输欧盟水产品和肠衣的"卫生证书"等。
（十一） 其他：
"证书续页"：适用于多页证书的情况
