为充分发挥集装箱运输的优越性，经营大型集装箱专用船的航运公司部被迫限制船舶的挂靠港数量。这样一来，非挂靠港腹地的货物就只能通过汽车或火车运往少数几个挂靠港(基本港)进行装船。这不仅使得传统的相对较为严格的腹地划分方式变得毫无意义，与此同时，由此所产生的货物“绕道运输”对于有些航线以及港口较为分散的情况而言，由于货主承担的内陆运费的增加，船公司的这种经营战略是否会被货主所接受却是个难题。为解决这一矛盾，减轻货主的内陆运输负担，目前世界上许多船公司在内陆运费的计收上采用较为灵活的方式，其中包括：
1.港口均等制(Port Equalisation Systems)
出于竞争战略考虑，班轮公会或非会员船公司为避免因大型集装箱船减少挂靠港数量使得某些货主的内陆运输费用增加而导致有可能失去这些货主，大多采用港口均等制来向货主收取内陆运输费用。这种方式的具体计费形式，根据班轮公会或船公司以及营运条件、时间的不同而有所不同。其中有的规定对非基本港腹地货物从该腹地运往基本港的内陆运费按其原来从该腹地运往该非基本港的内陆运费计收。也就是说，在内陆运输费用的计收上，基本港与非基本港是均等的，还有的规定以低于现行国家铁路运价的一定比例，比如20%，计收将集装箱货物从非基本港运到基本港的内陆铁路运费。
2.总分区制(Total Grid Systems)
由于港口均等制形式多样，变化也较频繁，货主不易掌握，而且常常出现对货主不公平的情况，因此在英国、意大利等国至美国的航线上，班轮公会采用了所谓的“总分区制”来计收内陆运费。这种计费形式的具体做法是，班轮公会将一个国家划分成许多小块(区)，分别计算出每一小块到各自最近的一个基本港的实际内陆运输费用，并以此作为班轮公会的内陆运费计收标准。这样船公司就可以在任何港口装运来自任何一个区的集装箱货物，并仅按该区到离其最近的一个基本港的内陆运费率计收内陆运费。这种计费形式可以说完全消除了港口均等制的不足，更易为货主所掌握和接受。
二、国际集装箱公路运价与费用计收
1.国际集装箱公路运价概述
在国际集装箱多式联运的内陆运输中，公路运输是最常见，也是最重要的一种运输方式。在公路运输价格与运费计收方法上，专业汽车运输公司与由承运人提供的汽车运输有所不同。专业汽车运输公司的计费方式主要有以下三种：
(1)重箱货的总里程运费加上空箱返回运费;
(2)按集装箱的往返行程划分不同的计程费率等级;
(3)分别对每个40ft、两个20ft空箱以及一个20ft重箱规定不同的费率。
船公司为货主提供的汽车运输所采用的计费方式是将上述(2)、(3)两种形式结合在一起，不同的是船公司提供的汽车运输只对重载行程和重箱收费，也就是说在按货主的指示将集装箱货物交付给货主后，船公司将免费把空箱运回。
2.我国的国际集装箱公路运价
根据交通部1987年9月发布的《国际集装箱汽车运输费收规则》的规定，我国国际集装箱公路运价的计价以箱为单位，按不同规格箱型的重箱、空箱计费。根据计价方式的不同，我国的国际集装箱公路运价分为计程运价、计时包车运价和包箱运价。计价单位分别为：元/箱公里、元/吨位小时和元/箱。同时，对于国际集装箱运输的计费里程，该规则规定包括运输里程和装卸里程，并以5km为起码计费里程，递进计算，尾数不足一公里的按一公里计算。同时规定，经承托双方协议，在一定地区或同一线路内进行多点运输时，可以按平均运输里程作为计费里程包干计算。
根据上述规则规定，我国的国际集装箱公路运输采用了全国统一的基本运价，各省市区根据当地实际情况，可以在全国统一基本运价的基础上，在20%上下幅度内，制定本地区实际的基本运价。但是，为解决我国各地集装箱公路运价多年来存在的费率水平偏低，运价与成本倒挂的现象，交通部于1991年以“关于调整国际集装箱汽车运输和汽车货运站部管费收项目基本费率的通知”，对原制定的费收规则作了修改和调整。其中20ft箱的全国统一基本运价由3.00元/箱公里调整为5.00元/箱公里，40ft箱由5.20元/箱公里调整为7.50元/箱公里。1992年为解决由于燃油价格上调和燃油供应平价转议价给经营公路运输造成的困难，交通部以“关于提高公路汽车运输省际零担货物运输、国际集装箱运输价格的通知”，将国际集装箱汽车运输基本价格提高了20%。其中20ft标准集装箱每箱公里由5元调整为6元，40ft标准集装箱每箱公里由7.50元调整为9.00元。
对于国际集装箱汽车运价的计算，交通部制定的上述规则规定，以重箱为计价基础，并分别规定了“单程重(空)箱价”、“双程重箱价”、“一程重(空)箱，一程空(重)箱价”和“双程空箱价”。
单程重(空)箱运价，按各省、市。自治区制定的国际集装箱汽车运输基本运价计算。
双程重箱运价的计算方法是，同一托运人同一去程和回程重箱，回程对流运输的重箱运价，按基本运价减成20%;提供不属于同j托运人的回程重箱，对各托运人均按对流运输部分的基本运价减成10%。
一程重(空)箱，一程空(重)箱运价的计算按以下方法进行：同一托运人托运的重箱去，同时空箱回，或空箱去同时重箱回的，按一程重箱计费，遇有空箱运输里程超过重箱运输里程的非对流运输部分按重箱运价计算。
对于同一托运人托运的双程空箱，其中较长一程的空箱按单程重箱计费，另一程捎运的空箱则免收运费。
对于标明是危险品的国际集装箱，根据上述规则规定应执行危险品运价。其中，放射性、易燃、易爆、烈性危险品运价在基本运价的基础上加价50%～100%;其他危险品运价在基本运价的基础上加价20%～50%。
此外，该国际集装箱汽车运输费收规则还规定了计时包车运价和包箱运价等计费形式。其中对于因下列原因对运输效率产生较大影响时，可采用计时包车运价：
(1)托运人原因使车辆不能按正常速度行驶;
(2)中途开箱时间过长;
(3)托运人自行确定车辆开停时间。
计时包车运价按计费时间、包用车辆的标记吨位和计时包车运价率计算。其中计费时间以小时为单位，起码计费时间为四小时，超过四小时者，以半小时为单位递进计算。
