集装箱运费包括内陆运费、拼箱费、堆场服务费、海运运费、集装箱及其设备使用费等。集装箱运费计收方法基本上有两种：以每运费吨(freight ton)为计算单位(按件杂货费率);按包箱费率以每个集装箱为计费单位。包箱费率将逐步取代件杂货费率。
2.货运单证
(1)托运单(booking note)：货代接受出口企业的订舱委托后缮制的单据，是向船公司订舱配载的依据(单据4.3和4.4)。该托运单一式数联，含场站收据。
(2)装箱单(container load plan CLP)：一式数份，整箱货由货主或货代填制，拼箱货由货运站填制，该单要与托运单完全一致。
(3)设备交接单(equipment interchange receipt)：是货柜所有人与用柜人之间划分责任的依据，是用柜人进出港区、场站及提柜、换柜的凭证。
(4)集装箱提单(container B/L)：上面载有货柜的收货地点、交货地点、集装箱号和铅封号等。
(5)提货单(delivery order)：收货人收到“到货通知”后，持正本提单向船方换取提货单，然后办理报关，经海关在“提货单”上盖章放行后，才能凭此单向船方委托的货场或货运站提箱或提货，收货人在提货单上盖章证明船方责任已经结束。
