船公司接受订舱后，确认价格和舱位无误，会给货代传调箱单（提箱单）或发放箱指令。如果订舱时需要什么单证，也都要提供给船公司，如非危保函，MSDS，化工鉴定，等等。
货代公司收到调箱单（提箱单）后，如果安排工厂装箱，则会把调箱单传给车队。如果安排码头或堆场装箱，则把调箱单传给码头或堆场。然后装货后再找车队或堆场要箱号。
有了准确的件数，重量，箱号了，则把客户提供的报关单据转到报关行，提前转也可以。报关单据包括：核销单，发票，箱单，合同，报关委托书，通关单，许可证，等等。等报关结束后，由报关行将场站收据交到码头。（以后再将海关退回的核销单返给货代，再返给客户。）
有了箱号以后，货代也要及时把箱号报给船公司。然后再跟客户确认准确的提单样本。再将正确的提单样本发给船公司，开船后由船公司出具提单。货代向船公司取回提单，再寄给客户。
.提箱单……其实通常直接叫SO，就是shipping order 。你向货代或者船公司订舱（这个过程叫订舱，也叫“下BOOKING”），船公司就会放出SO（这个过程叫放舱），车队根据SO去码头办理相关提柜手续（这个过程叫办单），另外，有些船公司的SO可以直接提柜。
2.配舱回单……这个概念，网上很多人误导为“入货单”……其实，应该是不同地方有不同做法或者叫法，反正我这边这些年都没听说过……一般来说，有些物流公司，在客人订舱后，会给一个“订舱确认”，然后出SO，或者“进仓通知”，这时，“订舱确认”可以理解为配舱回单……有些没有，直接就出SO了（因为订舱后，一般都是直接出SO的，不需要订舱确认，反正出SO不用钱）……另外，在驳船公司，也有一个配舱单，俗称“舱单”，跟这个“配舱回单”不同，是人家船公司的内部文件，一个配舱计划来的，跟货代货主这些无关的。
3.设备交接单……设备交接单货代这些接触比较少，是集装箱车队接触到的……车队拿SO或者提柜通知去码头或者船公司指定的地方办单，换取“提柜预约纸”（各地方不同），和“设备交接单”，然后凭这些去指定码头或者堆场提柜。
4.提单……提单（也叫海单、船东单）是船公司签发的，装完柜补料对好提单，一般在开船之后，就能出提单了……另外，有些航线或者物流公司，是出货代单的，需要在目的港换单才能办理提货手续。
海运托运
编制船期表。外运公司按月编印出口船期表，分发给各外贸公司及工贸企业，内列航线、船名及其国籍、抵港日期、截止收单期、预计装船日期和挂港港口名称（即船舶停靠的港口）。各外贸公司及工贸企业据此进行催证、备货。
办理托运。外贸公司在收到国外开来的信用证经审核（或经修改）无误后即可办理托运。按信用证或合同内有关装运条款填写《托运单》并提供全套单证，在截止收单期前送交外运公司，作为订舱的依据。
领取装运凭证。外运公司收到有关单证后，即缮制海运出口托运单，并会同有关船公司安排船只和舱位；然后由船公司据以签发装货单，作为通知船方收货装运的凭证。
装货、装船。外运公司根据船期，代各外贸公司往发货仓库提取货物运进码头，由码头理货公司理货，凭外轮公司签发的装货单
装船。
换取提单。货物装船完毕，由船长或大副签发“大副收据”或“场站收据”，载明收到货物的详细情况。托运人凭上述收据向有关船公司换取提单。
发出《装船通知》。货物装船后，托运人即可向国外买方发出《装船通知》，以便对方准备付款、赎单、办理收货。如为C&F或FOB合同，由于保险由买方自行办理，及时发出《装船通知》尤为重要。
空运托运
办理托运。各外贸公司及工贸企业在备齐货物，收到开来的信用证经审核（或经修改）无误后，就可办理托运，即按信用证和合同内有关装运条款，以及货物名称、件数、装运日期、目的地等填写《托运单》并提供有关单证，送交外运公司作为订航班的依据。
安排货舱。外运公司收到托运单及有关单据后，会同中国民航，根据配载原则、货物性质、货运数量、目的地等情况，结合航班，安排舱位，然后由中国民航签发航空运单。
装货、装机。外运公司根据航班，代各外贸公司或工贸企业往仓库提取货物送进机场，凭装货单据将货物送到指定舱位待运。
签发运单。货物装机完毕，由中国民航签发航空总运单，外运公司签发航空分运单，航空分运单有正本三份、副本十二份。正本三份，第一份交给发货人，第二份由外运公司留存，第三份随货同行交给收货人。副本十二份作为报关、财务结算、国外代理、中转分拨等用途。
发出装运通知。货物装机后，即可向买方发出装运通知，以便对方准备付款、赎单、办理收货。
这基本就是整个海运货代操作的整个流程，也包括了单证的流转过程
航空货代操作步骤
货主订舱委托----确认运价---航空公司预定舱位---确认舱位--货物入库---货物过磅及和客户确认重量(以航空公司重量为准)----开航空运单---航空公司货物交接---航班跟踪(第一手知道货物出运与否)---收取客户运费(国内空运一般情况都是现结运费)----将提单给客户或者直接帮客户传真到对方收货人并告知对方具体的提货时间提货地点。
