保税区是中国对外开放的最高形式，享有比经济特区、经济技术开发区更加优惠、更加灵活的政策，主要政策有：
第一、保税区视同“境内关外”。除国家禁止进出口的商品外，货物在保税区与境外之间可自由进出，不必报关，只需递交商业单证向海关备案，免领进出口许可证，免征关税；货物在保税区内可以自由流转，免征增值税、消费税；货物可在保税区内无限期储存。
第二、保税区与非保税区的加工企业经由海关核管可双向委托加工。非保税区货物进入保税区视同出口，并按出口规定办理手续，予以退税；保税区可以举办生产资料市场和开展商品展示业务，为“三资”企业提供设备、原辅材料、建筑材料和办公用品，起到储存和“蓄水池”的作用。
第三、保税区内允许各国货币流通。区内企业的外汇收入实行保留现汇，全额留存，周转使用的办法；区内企业可享受企业所得税和地方所得税的减免。
第四、保税区内企业进口为生产出口产品所需的原材料、零部件、元器件、包装物料等，予以保税；区内企业生产加工的产品出口，免征出口税；转口货物可在区内进行分级、挑选、刷贴标志、改装等简单加工；转口货物在区内实行保税，复出境时予以免税。
第五、国家鼓励区内企业根据国际市场的变化，储存关系国计民生和国内工农业生产急需的原料性商品，包括国家限制进口的商品。
第六、保税区注册企业的中方人员如需出国（境），经该人员原单位有权审批的部门批准，可在保税区办理出国（境）任务批件。
１９９７年，外经贸部发布了国家对保税区外经贸方面的有关政策：
一、保税区内企业与境外企业可以自由从事贸易活动；
二、保税区内企业与区外（系指保税区以外中国境内的其他地区）的国内企业从事一切贸易和商业
